Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palm3A2TJV2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms