Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam43bA2AM80 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fam43bA2AM80 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms