Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Calcoco2A2A6M5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms