Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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