Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm17190V9GX38 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm17190V9GX38 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms