Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms