Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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