Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1a4Q9WV27 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp1a4Q9WV27 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms