Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms