Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms