Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms