Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc4Q9QZD4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms