Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt3Q9QZ47 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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