Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms