Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trp53inp1Q9QXE4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms