Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer2Q9QWW1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms