Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms