Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot9Q9JKY0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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