Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms