Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms