Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp4Q9JIL5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp4Q9JIL5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms