Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MkksQ9JI70 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MkksQ9JI70 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms