Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff4Q9ESC8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff4Q9ESC8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff4Q9ESC8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff4Q9ESC8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff4Q9ESC8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff4Q9ESC8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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