Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rapgef4Q9EQZ6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rapgef4Q9EQZ6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms