Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms