Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubiad1Q9DC60 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms