Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms