Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SrpraQ9DBG7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SrpraQ9DBG7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SrpraQ9DBG7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SrpraQ9DBG7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SrpraQ9DBG7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrpraQ9DBG7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms