Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf580Q9DB38 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf580Q9DB38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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