Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp2aQ9DB34 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms