Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ift43Q9DA69 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ift43Q9DA69 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift43Q9DA69 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift43Q9DA69 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ift43Q9DA69 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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