Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capns2Q9D7J7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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