Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop56Q9D6Z1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop56Q9D6Z1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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