Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11fip1Q9D620 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms