Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D5Q8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms