Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krtap5-3Q9D226 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms