Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms