Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2e1Q9D0D5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms