Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snf8Q9CZ28 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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