Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mis12Q9CY25 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms