Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms