Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpainQ9CWY9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms