Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcf1Q9CTH6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Fcf1Q9CTH6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Fcf1Q9CTH6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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