Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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