Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atp6v0e1Q9CQD8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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