Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chmp3Q9CQ10 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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