Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg3Q9CPX6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms