Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms