Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd3Q99MJ6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms