Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp16Q99LG0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms